近年来呢，灭菌机灭菌硬镜有比较大的争议，其实灭菌机作为灭菌硬镜的设备之一，它是具有杀菌能力强及作用快速的特点，曾经一度成为活跃在硬镜灭菌的舞台上。主要集中在几下几个方面：
1、过滤水可能无法保持无菌状态，存在感染隐患；
2、灭菌后的硬镜残留的过氧乙酸浓度无法检测
3、冲洗接口和腔镜口径的应匹配，但灭菌系统无法满足所有腔镜的需要，因此存在隐患当处理硬镜时，错误的使用连接器会导致硬镜灭菌不完全，可能诱发硬镜相关感染；
4、高浓度过氧乙酸对碳钢、铝、铜有一定腐蚀，此类金属器械应慎用；
5、灭菌后转运过程存在污染的风险，存在感染隐患；
6、灭菌器的监测频率有待考证。《医疗机构消毒技术规范》和《医院消毒供应中心第3部分：清洗消毒及灭菌效果监测标准》中没有明确关于过氧乙酸灭菌机的物理、化学和生物监测的方法及标准。
